قامت المؤسسة بتطبيق منظومة متكاملة للتنمية منذ عام 2007 من خلال العمل على عدة محاور ومبادرات والتي تركز علي:
إنشاء مراكز تميز: داخل المستفيات الجامعية والعامة في مصر بتطوير البنية التحتية لهذه المنشآت الطبية والتعليمية وتوفير الاجهزه الطبية اللازمة حيث تتبع وفاءً لمصر نظاماً منهجياً ومؤسسياً للتطوير، وتركز فى مشروعاتها ومبادراتها على الاهتمام بكافة نواحي الخدمة الطبية المقدمة، وهو ما ينعكس على ملايين المرضى على المدى الطويل . وقد أثبتت هذه المنهجية إمكانية إحداث تأثير إيجابى وملموس، وهو ما لا يتطلب المشاركة بالموارد المادية فحسب، وإنما يحتاج بالأساس إلى مشاركة فعالة وإطار مؤسسى قوى يدعمه الانتماء والاهتمام ومتابعة كافة التفاصيل
تقوم المؤسسة بعدة مبادرات من اهمها:
الحد من قوائم الانتظار:حيث تتبني المؤسسة مبادرة الحد من قوائم الانتظار منذ عام 2007 بحيث تتكفل بكافة المصاريف والإعدادات اللازمة لإتمام أكبر عدد من العمليات الجراحية , كما تتحمل المؤسسة مسئولية تجديد وتجهيز أقسام كاملة داخل المستشفيات و توفير الأجهزة والمستلزمات الطبية وذلك نظرا للنقص الحاد في المستلزمات والأدوات والمعدات اللازمة لإجراء العمليات إلى جانب تدريب فريق العمل القائم على القسم من الأطباء والتمريض .
ميكنة بيانات المرضي: تحقق الميكنة شمول البيانات، بمعنى أن ملف المريض الالكتروني يحتوي على كل التقارير من شتي الأقسام وخطوات العلاج ونتائج التحاليل والأشعة، مما يسهل التشخيص والعلاج للحالة على ضوء ما يحدث لها من تطورات توفر الميكنة للمستشفى بيانات ومعلومات كاملة عن توزيع المرضي، ودور الفريق الطبي فئ العلاج، والأدوية والمستلزمات التي يتم صرفها من المخازن مما يعطى صورة كاملة عن الحالة لتوفير مخزون مناسب من احتياجات العملية العلاجية.كما توفر الميكنة ما كان يتم إهداره من وقت العاملين في البحث عن ملفات وسجلات بكميات كبيرة، وعادة لا تحتوي على كل البيانات.وييمكن الاتصال بالمراكز البحثية ومعرفة الخريطة العلاجية من خلال الميكنة والدفع بالمعلومات الكاملة عن الحالات الطبية المختلفة، وبالتالي يعاون تلك المراكز من الدراسة والتشخيص الدقيق , مؤسسة وفاءً لمصر هي اول مؤسسة مجتمع مدني تعمل على ميكنة المستشفيات الجامعية والحكومية فالمؤسسة تتفهم مميزات خدمة الميكنة و التي تساعد في البحث العلمي والإحصائيات .
